Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfrp1Q8BXL7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfrp1Q8BXL7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms