Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skor1Q8BX46 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skor1Q8BX46 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Skor1Q8BX46 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms