Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctdsp2Q8BX07 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp2Q8BX07 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms