Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TtpaQ8BWP5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtpaQ8BWP5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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