Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pggt1bQ8BUY9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms