Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pbrm1Q8BSQ9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pbrm1Q8BSQ9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms