Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
5730596B20RikQ8BQ08 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
5730596B20RikQ8BQ08 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms