Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gga3Q8BMI3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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Gga3Q8BMI3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gga3Q8BMI3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms