Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp54Q8BL06 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp54Q8BL06 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms