Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms