Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms