Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prune1Q8BIW1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prune1Q8BIW1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prune1Q8BIW1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prune1Q8BIW1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune1Q8BIW1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune1Q8BIW1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune1Q8BIW1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune1Q8BIW1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune1Q8BIW1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune1Q8BIW1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune1Q8BIW1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune1Q8BIW1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prune1Q8BIW1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms