Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms