Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Vipas39Q8BGQ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Vipas39Q8BGQ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Vipas39Q8BGQ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vipas39Q8BGQ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Vipas39Q8BGQ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Vipas39Q8BGQ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Vipas39Q8BGQ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Vipas39Q8BGQ1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Vipas39Q8BGQ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Vipas39Q8BGQ1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vipas39Q8BGQ1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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