Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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