Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sv2bQ8BG39 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms