Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M10.4Q85ZW8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-M10.4Q85ZW8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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