Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.5Q85ZW7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms