Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfascQ810U3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfascQ810U3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms