Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc172Q810N9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc172Q810N9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms