Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8Q80YR6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbbp8Q80YR6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms