Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg2bQ80XK6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms