Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ttc28Q80XJ3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc28Q80XJ3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ttc28Q80XJ3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ttc28Q80XJ3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ttc28Q80XJ3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc28Q80XJ3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ttc28Q80XJ3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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