Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc155Q80VJ8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc155Q80VJ8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms