Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab3gap1Q80UJ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab3gap1Q80UJ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab3gap1Q80UJ7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms