Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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RubcnQ80U62 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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RubcnQ80U62 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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RubcnQ80U62 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RubcnQ80U62 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RubcnQ80U62 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms