Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
NischQ80TM9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NischQ80TM9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NischQ80TM9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NischQ80TM9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
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