Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2q1Q7TSS2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2q1Q7TSS2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms