Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccp110Q7TSH4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccp110Q7TSH4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms