Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp3Q7TNH6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms