Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd1l2Q7TN88 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms