Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shq1Q7TMX5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shq1Q7TMX5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shq1Q7TMX5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms