Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim12Q78RX3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms