Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2bQ6ZWY6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms