Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nemp1Q6ZQE4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nemp1Q6ZQE4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nemp1Q6ZQE4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms