Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Glis3Q6XP49 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Glis3Q6XP49 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Glis3Q6XP49 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Glis3Q6XP49 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms