Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2b2Q6UGQ3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms