Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil2Q6R2P8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neil2Q6R2P8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms