Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcaf3Q6QR59 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcaf3Q6QR59 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms