Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp2b4Q6Q477 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b4Q6Q477 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms