Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HjurpQ6PG16 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms