Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf4Q6PFF0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms