Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf1Q6PDM2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf1Q6PDM2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms