Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mfsd4aQ6PDC8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4aQ6PDC8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms