Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gapvd1Q6PAR5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gapvd1Q6PAR5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gapvd1Q6PAR5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms