Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Tsen2Q6P7W5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsen2Q6P7W5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms