Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg2aQ6P4T0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms