Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frg2f1Q6P3A2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Frg2f1Q6P3A2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frg2f1Q6P3A2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms