Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Slx4Q6P1D7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Slx4Q6P1D7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Slx4Q6P1D7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms