Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rprd2Q6NXI6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms